Pracownia Farmakogenomiki
Profil naukowy
- O pracowni
- Pracownicy
- Zakład nadrzędny
Przedmiotem badań naukowych prowadzonych w Pracowni jest poszukiwanie biologicznych korelatów stanów i procesów powiązanych z farmakoterapią występujących na poziomie molekularnym. Celem jest identyfikacja nowych punktów uchwytu, wskaźników efektywności i bezpieczeństwa terapii oraz interakcji leki-geny o znaczeniu klinicznym. W szczególności badania dotyczą leków psychotropowych stosowanych w leczeniu depresji, zaburzeń psychotycznych i lękowych oraz innych związków psychoaktywnych.
Badania prowadzone są na poziomie genów, zarówno w zakresie różnic w sekwencji DNA występujących u ludzi jak i zmian poziomów ekspresji poszczególnych transkryptów. Wspólnym elementem metodycznym jest stosowane bioinformatycznych narzędzi do analizy i interpretacji dużych zbiorów danych genomowych. Podstawowym źródłem wyników jest technologia wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA (NGS, ang. next-generation sequencing), która umożliwia pomiary w skali pełnej sekwencji genomów oraz transkryptomów. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pozwala zarówno na prowadzenie asocjacyjnych badań genetycznych, jak pomiarów zmian ekspresji izoform transkrypcyjnych oraz niekodujących RNA.
Pracownicy pracowni
Dokonania naukowe
- Publikacje
Mechanisms of Attenuation of Pulmonary V'O2 Slow Component in Humans after Prolonged Endurance Training.
Zoladz JA, Majerczak J, Grassi B, Szkutnik Z, Korostyński M, Gołda S, Grandys M, Jarmuszkiewicz W, Kilarski W, Karasinski J, Korzeniewski B
DOI: 10.1371/journal.pone.0154135
Kainic Acid Induces mTORC1-Dependent Expression of Elmo1 in Hippocampal Neurons.
Blazejczyk M, Macias M, Korostynski M, Firkowska M, Piechota M, Skalecka A, Tempes A, Koscielny A, Urbanska M, Przewlocki R, Jaworski J
DOI: 10.1007/s12035-016-9821-6
Seqinspector: position-based navigation through the ChIP-seq data landscape to identify gene expression regulators.
Piechota M, Korostynski M, Ficek J, Tomski A, Przewlocki R
DOI: 10.1186/s12859-016-0938-4
Transcriptional Effects of Heroin and Methamphetamine in the Striatum
Przewlocki, R., Korostynski, M., Piechota, M.
DOI: 10.1016/B978-0-12-800213-1.00087-0
Transcriptional Effects of Heroin and Methamphetamine in the Striatum
Przewlocki, R., Korostynski, M., Piechota, M.
DOI: 10.1016/B978-0-12-800213-1.00087-0
Molecular profile of dissociative drug ketamine in relation to its rapid antidepressant action
Ficek, J., Zygmunt, M., Piechota, M., Hoinkis, D., Rodriguez Parkitna, J., Przewlocki, R., Korostynski, M.
DOI: 10.1186/s12864-016-2713-3
Seqinspector: Position-based navigation through the ChIP-seq data landscape to identify gene expression regulators
Piechota, M., Korostynski, M., Ficek, J., Tomski, A., Przewlocki, R.
DOI: 10.1186/s12859-016-0938-4
Genome-wide meta-analysis of cerebral white matter hyperintensities in patients with stroke.
Traylor M, Zhang CR, Adib-Samii P, Devan WJ, Parsons OE, Lanfranconi S, Gregory S, Cloonan L, Falcone GJ, Radmanesh F, Fitzpatrick K, Kanakis A, International Stroke Genetics Consortium
DOI: 10.1212/WNL.0000000000002263
Regulation of alternative gene transcription in the striatum in response to antidepressant drugs.
Piechota M, Golda S, Ficek J, Jantas D, Przewlocki R, Korostynski M
DOI: 10.1016/j.neuropharm.2015.08.006
Opioid-dependent regulation of high and low fear responses in two inbred mouse strains.
Szklarczyk K, Korostynski M, Cieslak PE, Wawrzczak-Bargiela A, Przewlocki R
DOI: 10.1016/j.bbr.2015.06.001