Pracownia Farmakogenomiki
Profil naukowy
- O pracowni
- Pracownicy
- Zakład nadrzędny
Przedmiotem badań naukowych prowadzonych w Pracowni jest poszukiwanie biologicznych korelatów stanów i procesów powiązanych z farmakoterapią występujących na poziomie molekularnym. Celem jest identyfikacja nowych punktów uchwytu, wskaźników efektywności i bezpieczeństwa terapii oraz interakcji leki-geny o znaczeniu klinicznym. W szczególności badania dotyczą leków psychotropowych stosowanych w leczeniu depresji, zaburzeń psychotycznych i lękowych oraz innych związków psychoaktywnych.
Badania prowadzone są na poziomie genów, zarówno w zakresie różnic w sekwencji DNA występujących u ludzi jak i zmian poziomów ekspresji poszczególnych transkryptów. Wspólnym elementem metodycznym jest stosowane bioinformatycznych narzędzi do analizy i interpretacji dużych zbiorów danych genomowych. Podstawowym źródłem wyników jest technologia wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA (NGS, ang. next-generation sequencing), która umożliwia pomiary w skali pełnej sekwencji genomów oraz transkryptomów. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pozwala zarówno na prowadzenie asocjacyjnych badań genetycznych, jak pomiarów zmian ekspresji izoform transkrypcyjnych oraz niekodujących RNA.
Pracownicy pracowni
Dokonania naukowe
- Publikacje
Systemic response to rupture of intracranial aneurysms involves expression of specific gene isoforms
Korostynski, M., Piechota, M., Morga, R., Hoinkis, D., Golda, S., Zygmunt, M., Dziedzic, T., Moskala, M., Slowik, A., Pera, J.
DOI: 10.1186/s12967-019-1891-6
Cell-type-specific gene expression patterns in the knee cartilage in an osteoarthritis rat model
Korostynski, M., Malek, N., Piechota, M., Starowicz, K.
DOI: 10.1007/s10142-017-0576-6
Whole-exome sequencing identifies novel pathogenic mutations and putative phenotype-influencing variants in Polish limb-girdle muscular dystrophy patients
Fichna, J.P., MacIas, A., Piechota, M., Korostynski, M., Potulska-Chromik, A., Redowicz, M.J., Zekanowski, C.
DOI: 10.1186/s40246-018-0167-1
Expression of alternatively spliced variants of the Dclk1 gene is regulated by psychotropic drugs
Zygmunt, M., Hoinkis, D., Hajto, J., Piechota, M., Skupień-Rabian, B., Jankowska, U., Kȩdracka-Krok, S., Rodriguez Parkitna, J., Korostyński, M.
DOI: 10.1186/s12868-018-0458-4
Transcriptional signatures of steroid hormones in the striatal neurons and astrocytes
Marcin Piechota, Michał Korostynski, Slawomir Golda, Joanna Ficek, Danuta Jantas, Ziolkowska Barbara, Ryszard Przewlocki
DOI: 10.1186/s12868-017-0352-5
Blood Transcriptional Signatures for Disease Progression in a Rat Model of Osteoarthritis
Korostyński, M., Małek, N., Piechota, M., Starowicz, K.
DOI: 10.1155/2017/1746426
Kainic Acid Induces mTORC1-Dependent Expression of Elmo1 in Hippocampal Neurons
Blazejczyk, M., Macias, M., Korostynski, M., Firkowska, M., Piechota, M., Skalecka, A., Tempes, A., Koscielny, A., Urbanska, M., Przewlocki, R., Jaworski, J.
DOI: 10.1007/s12035-016-9821-6
Looking for new diagnostic tools and biomarkers of hypertension in obese pediatric patients
Strojny, W., Drozdz, D., Fijorek, K., Korostynski, M., Piechota, M., Balwierz, W., Pietrzyk, J.A., Kwinta, P., Siedlar, M., Skoczen, S.
DOI: 10.1097/MBP.0000000000000242
Behavioral and transcriptional patterns of protracted opioid self-administration in mice
Skupio, U., Sikora, M., Korostynski, M., Wawrzczak-Bargiela, A., Piechota, M., Ficek, J., Przewlocki, R.
DOI: 10.1111/adb.12449
Molecular profile of dissociative drug ketamine in relation to its rapid antidepressant action.
Ficek J, Zygmunt M, Piechota M, Hoinkis D, Rodriguez Parkitna J, Przewlocki R, Korostynski M
DOI: 10.1186/s12864-016-2713-3