Pracownia Farmakogenomiki
Profil naukowy
- O pracowni
- Pracownicy
- Zakład nadrzędny
Przedmiotem badań naukowych prowadzonych w Pracowni jest poszukiwanie biologicznych korelatów stanów i procesów powiązanych z farmakoterapią występujących na poziomie molekularnym. Celem jest identyfikacja nowych punktów uchwytu, wskaźników efektywności i bezpieczeństwa terapii oraz interakcji leki-geny o znaczeniu klinicznym. W szczególności badania dotyczą leków psychotropowych stosowanych w leczeniu depresji, zaburzeń psychotycznych i lękowych oraz innych związków psychoaktywnych.
Badania prowadzone są na poziomie genów, zarówno w zakresie różnic w sekwencji DNA występujących u ludzi jak i zmian poziomów ekspresji poszczególnych transkryptów. Wspólnym elementem metodycznym jest stosowane bioinformatycznych narzędzi do analizy i interpretacji dużych zbiorów danych genomowych. Podstawowym źródłem wyników jest technologia wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA (NGS, ang. next-generation sequencing), która umożliwia pomiary w skali pełnej sekwencji genomów oraz transkryptomów. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pozwala zarówno na prowadzenie asocjacyjnych badań genetycznych, jak pomiarów zmian ekspresji izoform transkrypcyjnych oraz niekodujących RNA.
Pracownicy pracowni
Dokonania naukowe
- Publikacje
Local peripheral opioid effects and expression of opioid genes in the spinal cord and dorsal root ganglia in neuropathic and inflammatory pain.
Obara I, Parkitna JR, Korostynski M, Makuch W, Kaminska D, Przewlocka B, Przewlocki R
DOI: 10.1016/j.pain.2008.12.006
Regulation of ERK1/2 phosphorylation by acute and chronic morphine - implications for the role of cAMP-responsive element binding factor (CREB)-dependent and Ets-like protein-1 (Elk-1)-dependent transcription; small interfering RNA-based strategy.
Ligeza A, Wawrzczak-Bargiela A, Kaminska D, Korostynski M, Przewlocki R
DOI: 10.1111/j.1742-4658.2008.06531.x
Identification of interleukin-1 and interleukin-6-responsive genes in human monocyte-derived macrophages using microarrays.
Jura J, Wegrzyn P, Korostyński M, Guzik K, Oczko-Wojciechowska M, Jarzab M, Kowalska M, Piechota M, Przewłocki R, Koj A
DOI: 10.1016/j.bbagrm.2008.04.006
Interleukin-1 alpha has antiallodynic and antihyperalgesic activities in a rat neuropathic pain model.
Mika J, Korostynski M, Kaminska D, Wawrzczak-Bargiela A, Osikowicz M, Makuch W, Przewlocki R, Przewlocka B
DOI: 10.1016/j.pain.2008.02.015
Identification of interleukin-1 and interleukin-6-responsive genes in human monocyte-derived macrophages using microarrays
Jura, J., Wegrzyn, P., Korostyński, M., Guzik, K., Oczko-Wojciechowska, M., Jarzab, M., Kowalska, M., Piechota, M., Przewłocki, R., Koj, A.
DOI: 10.1016/j.bbagrm.2008.04.006
Morphine effects on striatal transcriptome in mice
Korostynski, M., Piechota, M., Kaminska, D., Solecki, W., Przewlocki, R.
DOI: 10.1186/gb-2007-8-6-r128
Morphine effects on striatal transcriptome in mice.
Korostynski M, Piechota M, Kaminska D, Solecki W, Przewlocki R
DOI: 10.1186/gb-2007-8-6-r128
Comparison of gene expression profiles in neuropathic and inflammatory pain.
Rodriguez Parkitna J, Korostynski M, Kaminska-Chowaniec D, Obara I, Mika J, Przewlocka B, Przewlocki R
DOI:
Gene expression profiling in the striatum of inbred mouse strains with distinct opioid-related phenotypes.
Korostynski M, Kaminska-Chowaniec D, Piechota M, Przewlocki R
DOI: 10.1186/1471-2164-7-146
Gene expression profiling in the striatum of inbred mouse strains with distinct opioid-related phenotypes
Korostynski, M., Kaminska-Chowaniec, D., Piechota, M., Przewlocki, R.
DOI: 10.1186/1471-2164-7-146