Pracownia Farmakogenomiki
Profil naukowy
- O pracowni
- Pracownicy
- Zakład nadrzędny
Przedmiotem badań naukowych prowadzonych w Pracowni jest poszukiwanie biologicznych korelatów stanów i procesów powiązanych z farmakoterapią występujących na poziomie molekularnym. Celem jest identyfikacja nowych punktów uchwytu, wskaźników efektywności i bezpieczeństwa terapii oraz interakcji leki-geny o znaczeniu klinicznym. W szczególności badania dotyczą leków psychotropowych stosowanych w leczeniu depresji, zaburzeń psychotycznych i lękowych oraz innych związków psychoaktywnych.
Badania prowadzone są na poziomie genów, zarówno w zakresie różnic w sekwencji DNA występujących u ludzi jak i zmian poziomów ekspresji poszczególnych transkryptów. Wspólnym elementem metodycznym jest stosowane bioinformatycznych narzędzi do analizy i interpretacji dużych zbiorów danych genomowych. Podstawowym źródłem wyników jest technologia wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA (NGS, ang. next-generation sequencing), która umożliwia pomiary w skali pełnej sekwencji genomów oraz transkryptomów. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pozwala zarówno na prowadzenie asocjacyjnych badań genetycznych, jak pomiarów zmian ekspresji izoform transkrypcyjnych oraz niekodujących RNA.
Pracownicy pracowni
Dokonania naukowe
- Publikacje
MicroRNA Let-7e in the Mouse Prefrontal Cortex Differentiates Restraint-Stress-Resilient Genotypes from Susceptible Genotype
Joanna Solich, Magdalena Kolasa, Agata Faron-Górecka, Jacek Hajto, Marcin Piechota, Marta Dziedzicka-Wasylewska
DOI: 10.3390/ijms22179439
Role of Non-Coding Regulatory Elements in the Control of GR-Dependent Gene Expression
Malgorzata Borczyk, Mateusz Zieba, Michał Korostyński, Marcin Piechota
DOI: 10.3390/ijms22084258
Cocaine abstinence modulates NMDA receptor subunit expression: An analysis of the GluN2B subunit in cocaine-seeking behavior
Smaga, I., Wydra, K., Piechota, M., Caffino, L., Fumagalli, F., Sanak, M., Filip, M.
DOI: 10.1016/j.pnpbp.2021.110248
Cocaine attenuates acid sphingomyelinase activity during establishment of addiction-related behavior—A translational study in rats and monkeys
Frankowska, M., Jesus, F.M., Mühle, C., Pacheco, J.V.N., Maior, R.S., Sadakierska-Chudy, A., Smaga, I., Piechota, M., Kalinichenko, L.S., Gulbins, E., Kornhuber, J., Filip, M., Müller, C.P., Barros, M.
DOI: 10.1111/adb.12955
Maternal dietary patterns are associated with susceptibility to a depressive-like phenotype in rat offspring
Gawlińska, K., Gawliński, D., Korostyński, M., Borczyk, M., Frankowska, M., Piechota, M., Filip, M., Przegaliński, E.
DOI: 10.1016/j.dcn.2020.100879
Effects of l-dopa on gene expression in the frontal cortex of rats with unilateral lesions of midbrain dopaminergic neurons
Radlicka, A., Kamińska, K., Borczyk, M., Piechota, M., Korostyński, M., Pera, J., Lorenc-Koci, E., Parkitna, J.R.
DOI: 10.1523/ENEURO.0234-20.2020
Comparison of blood pressure values and expression of genes associated with hypertension in children before and after hematopoietic cell transplantation
Strojny, W., Kwiecińska, K., Fijorek, K., Korostyński, M., Piechota, M., Balwierz, W., Skoczeń, S.
DOI: 10.1038/s41598-021-88848-7
Toll-like receptor 4-mediated cytokine synthesis and post-stroke depressive symptoms
Korostynski, M., Hoinkis, D., Piechota, M., Golda, S., Pera, J., Slowik, A., Dziedzic, T.
DOI: 10.1038/s41398-021-01359-x
Genetic Profiling in Children With Acute Lymphoblastic Leukemia Referred for Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation
Kwiecinska, K., Strojny, W., Bik-Multanowski, M., Michal Korostynski, Piechota, M., Balwierz, W., Szymon Skoczen
DOI: 10.1177/10732748211064776
Prospects for personalization of depression treatment with genome sequencing
Borczyk, M., Piechota, M., Rodriguez Parkitna, J., Korostynski, M.
DOI: 10.1111/bph.15470